--- /tmp/seqan2-2.4.0+dfsg-14w0oitfsv/debian/seqan-apps_2.4.0+dfsg-14_amd64.deb +++ seqan-apps_2.4.0+dfsg-14_amd64.deb ├── control.tar.xz │ ├── control.tar │ │ ├── ./md5sums │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │┄ Files differ ├── data.tar.xz │ ├── data.tar │ │ ├── file list │ │ │ @@ -207,15 +207,15 @@ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 1120 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/share/man/man1/sak.1.gz │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 1165 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/share/man/man1/seqan_tcoffee.1.gz │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 2200 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/share/man/man1/snp_store.1.gz │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 2095 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/share/man/man1/splazers.1.gz │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 1493 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/share/man/man1/stellar.1.gz │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 669 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/share/man/man1/tree_recon.1.gz │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 671 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/share/man/man1/yara_indexer.1.gz │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 1519 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/share/man/man1/yara_mapper.1.gz │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 1521 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/share/man/man1/yara_mapper.1.gz │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/bin/alf -> ../lib/seqan/bin/alf │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/bin/gustaf -> ../lib/seqan/bin/gustaf │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/bin/insegt -> ../lib/seqan/bin/insegt │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/bin/mason_frag_sequencing -> ../lib/seqan/bin/mason_frag_sequencing │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/bin/mason_genome -> ../lib/seqan/bin/mason_genome │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/bin/mason_materializer -> ../lib/seqan/bin/mason_materializer │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2021-02-13 20:18:04.000000 ./usr/bin/mason_methylation -> ../lib/seqan/bin/mason_methylation │ │ ├── ./usr/share/man/man1/yara_mapper.1.gz │ │ │ ├── yara_mapper.1 │ │ │ │ @@ -71,8 +71,8 @@ │ │ │ │ Rescue unaligned ends within this percentual number of indels. In range [0..50]. Default: \fI25\fP. │ │ │ │ .TP │ │ │ │ \fB-ni\fP, \fB--no-indels\fP │ │ │ │ Turn off the rescue of unaligned ends containing indels. │ │ │ │ .SS Performance Options: │ │ │ │ .TP │ │ │ │ \fB-t\fP, \fB--threads\fP \fIINTEGER\fP │ │ │ │ -Specify the number of threads to use. In range [1..2048]. Default: \fI4\fP. │ │ │ │ +Specify the number of threads to use. In range [1..2048]. Default: \fI32\fP.